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以上两种银行保函办理方法的优势对比1，直接银行办理优点：乙方自主选择开具保函的银行，只需要少量的银行工本费，仅适合办理五万元以下或者对银行的保证责任较轻的履约保函。缺点：1客户自己去提交资料。2银行对保函格式的要求比较严格，如果保函格式索赔条款比较严格，让银行的赔付责任较重，银行审核很难通过。3银行出具保函需要客户存入同等金额的保证金，对客户来说并没有节省资金。2，第三方担保公司办理1 担保公司办理银行保函，只要项目真实有效，甲乙双方正常经营，保函办理难度都不大，保函格式的接纳度也更高。2 担保公司办理银行保函即可省出全部或者大部分保证金，客户只需要付给担保公司担保费即可（约2%，看具体项目增减），银行划扣担保公司额度。3 保证金何时退回？1 不管保函是否到期或工程完工，只需甲方将保函退回乙方，并且出具保函责任免除书面报告后可以退回保证金，或者超过保函有效期，保函自动失效。此上两种情况，乙方可以直接向银行申请解保，银行即可退回保证金至乙方。
银行保函： 1. 银行保函又称保证书，是指银行、保险公司、担保公司或担保人应申请人的请求，向受益人开立的一种书面信用担保凭证，保证在申请人未能按双方协议履行其责任或义务时，由担保人代其履行一定金额、一定时限范围内的某种支付或经济赔偿责任； 2. 现阶段常用的银行保函为：投标保函、履约保函、支付保函、预付款保函。 履约保函： 1. 履约保函 Performance Guarantee，指应劳务方和承包方（申请人）的请求，银行金融机构向工程的业主方（受益人）做出的一种履约保证承诺； 2. 如果劳务方和承包方日后未能按时、按质、按量完成其所承建的工程，则银行将向业主方支付一笔约占合约金额5%~10%的款项； 3. 履约保函有一定的格式限制，也有一定的条件。 商业保函： 商业保函是指除银行以外有信誉的，实力雄厚的商业机构出具的保函。
个人建议，如果您的项目，在一两个月的情况下就能完成，就跟甲方协调下，尽量别在开保函了，能给自己的企业节省一大笔费用，如果时间比较长，就需要开延期保函了，其实延期保函，就是重新开保函，跟上次出保函的流程时候一样的。
把保函与跟单信用证相比，当事人的权利和义务基本相同，所不同的是跟单信用证要求受益人提交的单据是包括运输单据在内的商业单据，而保函要求的单据实际上是受益人出具的关于委托人违约的声明或证明。这一区别，使两者适用范围有了很大的不同，保函可适用于各种经济交易中，为契约的一方向另一方提供担保。另外，如果委托人没有违约，保函的担保人就不必为承担赔偿责任而付款。而信用证的开证行则必须先行付款。
商业保函的制度保障和政策支持：
（1）2016年12月27日，为贯彻落实《国务院办公厅关于清理规范工程建设领域保证金的通知》（国办发〔2016〕49号）精神，规范建设工程质量保证金管理，住房城乡建设部、财政部下发了《关于印发建设工程质量保证金管理办法的通知》（建质〔2016〕295 号），为工程质量保证金管理提供了制度保障；
（2）2017年2月12日，《国务院办公厅关于促进建筑业持续健康发展的意见》，引导承包企业以银行保函或担保公司保函的形式，向建设单位提供履约担保。
（3）2017年6月20日，为贯彻落实国务院关于进一步清理规范涉企收费、切实减轻建筑业企业负担的精神，规范建设工程质量保证金管理，住房城乡建设部、财政部对《建设工程质量保证金管理办法》（建质〔2016〕295号）进行了修订，下发了《关于印发建设工 程质量保证金管理办法的通知》建质〔2017〕138号；
（4）2017年8月2日，《融资担保公司监督管理条例》，工程保证金大变革，保证金将退出历史舞台。
（5）2017年8月21日，国资委与住建部办公厅联合下发了《关于进一步推动中央企业工程建设领域保证金保函替代工作有关事项的通知》（国资厅发财管〔2017〕49 号）
（6）2017年9月26日，财政部工业和信息化部下发了《关于公布国务院部门涉企保证金目录清单的通知》（工信部联运行〔2017〕236号）
（7）2018年4月4日。国务院办公厅关于促进建筑业持续健康发展的意见，国办发〔2017〕19号，意见中第五大点第（九）条明确指出：加强承包履约管理。引导承包企业以银行保函或担保公司保函的形式，向建设单位提供履约担保。