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以上两种银行保函办理方法的优势对比1，直接银行办理优点：乙方自主选择开具保函的银行，只需要少量的银行工本费，仅适合办理五万元以下或者对银行的保证责任较轻的履约保函。缺点：1客户自己去提交资料。2银行对保函格式的要求比较严格，如果保函格式索赔条款比较严格，让银行的赔付责任较重，银行审核很难通过。3银行出具保函需要客户存入同等金额的保证金，对客户来说并没有节省资金。2，第三方担保公司办理1 担保公司办理银行保函，只要项目真实有效，甲乙双方正常经营，保函办理难度都不大，保函格式的接纳度也更高。2 担保公司办理银行保函即可省出全部或者大部分保证金，客户只需要付给担保公司担保费即可（约2%，看具体项目增减），银行划扣担保公司额度。3 保证金何时退回？1 不管保函是否到期或工程完工，只需甲方将保函退回乙方，并且出具保函责任免除书面报告后可以退回保证金，或者超过保函有效期，保函自动失效。此上两种情况，乙方可以直接向银行申请解保，银行即可退回保证金至乙方。
保函又称保证书，是指银行、保险公司、担保公司或个人应申请人的请求，向第三方开立的一种书面信用担保凭证。保证在申请人未能按双方协议履行起责任或义务时，由担保人代其履行一定金额、一定期限范围内的某种支付责任或经济赔偿责任。 保函即为保证书，为了方便，船公司及银行都印有一定格式的保证书。其作用包括凭保函交付货物、凭保函签发清洁提单、凭保函倒签预借提单等。
银行保函又称银行保证书，也属银行信用，是指银行应申请人或委托人的要求向受益方开出的，担保申请人一定履行某种义务，并在申请人未能按规定履行其责任和义务时，由担保行代其支付一定金额、或作出一定经济赔偿的书面文件。 国际贸易中，跟单信用证为买方向卖方提供了银行信用作为付款保证，但不适用于需要为卖方向买方作担保的场合，也不适用于国际经济合作中货物买卖以外的其他各种交易方式。然而在国际经济交易中，合同当事人为了维护自己的经济利益，往往需要对可能发生的风险采取相应的保障措施，银行保函和备用信用证，就是以银行信用的形式所提供的保障措施。 银行保函是由银行开立的承担付款责任的一种担保凭证，银行根据保函的规定承担付款责任。银行保函大多属于“见索即付”（无条件保函），是不可撤销的文件。银行保函的当事人有委托人（要求银行开立保证书的一方）、受益人（收到保证书并凭此向 银行索偿的一方）、担保人（保函的开立人）。
商业保函的制度保障和政策支持：
（1）2016年12月27日，为贯彻落实《国务院办公厅关于清理规范工程建设领域保证金的通知》（国办发〔2016〕49号）精神，规范建设工程质量保证金管理，住房城乡建设部、财政部下发了《关于印发建设工程质量保证金管理办法的通知》（建质〔2016〕295 号），为工程质量保证金管理提供了制度保障；
（2）2017年2月12日，《国务院办公厅关于促进建筑业持续健康发展的意见》，引导承包企业以银行保函或担保公司保函的形式，向建设单位提供履约担保。
（3）2017年6月20日，为贯彻落实国务院关于进一步清理规范涉企收费、切实减轻建筑业企业负担的精神，规范建设工程质量保证金管理，住房城乡建设部、财政部对《建设工程质量保证金管理办法》（建质〔2016〕295号）进行了修订，下发了《关于印发建设工 程质量保证金管理办法的通知》建质〔2017〕138号；
（4）2017年8月2日，《融资担保公司监督管理条例》，工程保证金大变革，保证金将退出历史舞台。
（5）2017年8月21日，国资委与住建部办公厅联合下发了《关于进一步推动中央企业工程建设领域保证金保函替代工作有关事项的通知》（国资厅发财管〔2017〕49 号）
（6）2017年9月26日，财政部工业和信息化部下发了《关于公布国务院部门涉企保证金目录清单的通知》（工信部联运行〔2017〕236号）
（7）2018年4月4日。国务院办公厅关于促进建筑业持续健康发展的意见，国办发〔2017〕19号，意见中第五大点第（九）条明确指出：加强承包履约管理。引导承包企业以银行保函或担保公司保函的形式，向建设单位提供履约担保。